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Linux で MySQL / MariaDB を使用して MirthConnect をインストールする 8 つの手順

Mirth Connect は、主に医療分野で使用されるオープン ソースの統合エンジンです。

これは、企業がさまざまなシステムを統合し、共通の言語で相互に対話できるようにするさまざまな医療標準 (HL7、XML、EDI/X12、DICOM など) をサポートします。

MirthConnect インターフェイス エンジンは、2 つのシステムを接続するためのさまざまな標準プロトコル (TCP、HTTP、JDBS、SFTP など) もサポートしています。

デフォルトでは、mirthconnect をインストールすると、ストレージ エンジンとして Apache Derby が使用されます。ただし、MySQL / MariaDB、PostgreSQL、Oracle、SQL Server など、一般的なデータベースのほぼすべてをサポートしています。

このチュートリアルでは、MirthConnect オープン ソース ソフトウェアをインストールし、Linux プラットフォーム上の MySQL データベースと通信するように構成する方法について説明します。

オープン ソース バージョンでサポートされている次のコネクタと形式:

  • コネクタ:TCP、MLLP、HTTP、FTP、DICOM、SOAP、SQL、JMS、ファイル システム、HTTPS、POP3、IMAP、ASTM、RS232
  • フォーマット:XML、HL7、DICOM、NCPDP、X12、区切りテキスト、生バイナリ

最近、NextGen は mirthconnect を買収しました。商用バージョンは、CCD、C-CDA、ASTM などのいくつかの追加フォーマットをサポートしています。また、商用バージョンには、高度なエンタープライズ拡張機能がいくつか含まれています。例:SSL マネージャー、ロールベースのアクセス制御、高度なアラート、チャネル履歴、LDAP 認証、HL7 メッセージ ジェネレーター。

このチュートリアルでは、Mirth Connect のオープン ソース バージョンを MySQL データベースにインストールする方法を説明します。

ステップ 1:前提条件:Java JDK をインストールする

以下に示すように、JDK 1.8 がシステムにインストールされていることを確認してください。

# java -version
openjdk version "1.8.0_102"
OpenJDK Runtime Environment (build 1.8.0_102-b14)
OpenJDK 64-Bit Server VM (build 25.102-b14, mixed mode)

JDK がインストールされていない場合は、以下に示すように yum を使用してインストールします。

yum -y install java-1.8.0-openjdk

システムに次の JDK 関連パッケージがインストールされているはずです:

# rpm -qa | grep -i jdk
java-1.8.0-openjdk-headless-1.8.0.102-1.b14.el7_2.x86_64
java-1.8.0-openjdk-1.8.0.102-1.b14.el7_2.x86_64
java-1.8.0-openjdk-devel-1.8.0.102-1.b14.el7_2.x86_64

ステップ 2:MySQL/MariaDB をインストールする

前述のように、デフォルトでは、mirthconnect にはデフォルトのデータベースとして Apache Derby が付属しています。

ただし、このチュートリアルでは、MySQL / MariaDB データベースをインストールして構成し、それを mirthconnect に使用します。

以下に示すように、MySQL / MariaDB サーバーをインストールします。このためには、次の 2 つの mariadb パッケージをインストールする必要があります。

yum install mariadb

yum install mariadb-server

注:古いバージョンの Linux ディストリビューションを使用している場合、mariadb-server パッケージが yum リポジトリで利用できない場合は、以下に示すように mysql-server パッケージをインストールしてください。

yum install mysql-server

MariaDB がインストールされると、システムに次のパッケージが表示されます。

# rpm -qa | grep -i maria
mariadb-5.5.50-1.el7_2.x86_64
mariadb-server-5.5.50-1.el7_2.x86_64
mariadb-libs-5.5.50-1.el7_2.x86_64

mariadb をインストールしたら、それを起動して、正しく実行されていることを確認してください。

systemctl start mariadb

systemctl status mariadb

以下を実行して、MySQL/MariaDB インストールのセキュリティ設定をセットアップすることもできます。これにより、データベースの root パスワードも割り当てられます。

/usr/bin/mysql_secure_installation

ステップ 3:MirthConnect 用の MySQL データベースを作成する

mirthconnect インストールで使用される「thegeekstuff」というデータベースを作成しましょう。

これには、以下に示すように、mysql の root ユーザー名とパスワードを指定して mysql コマンドを使用します。

# mysql -u root -pMySQLRootPwd
MariaDB [(none)]> create database thegeekstuff;

データベースが作成されたら、「thegeekstuff」というユーザーを作成し、これにパスワードを割り当てます。このアカウントは、mirthconnect 構成でデータベースと通信するために使用されます。

MariaDB [(none)]> grant all on thegeekstuff.* to 'thegeekstuff'@'localhost' identified by 'DBSecretPwd!' with grant option;

MariaDB [(none)]> flush privileges;

この段階では、このデータベースに mirthconnnect 関連のテーブルは表示されません。ただし、mirthconnect をインストールすると、ここに複数のテーブルが表示されます。

# mysql -u root -pMySQLRootPwd
MariaDB [(none)]> use sysadmin;
Database changed
MariaDB [sysadmin]> show tables;
Empty set (0.00 sec)

ステップ 4:Mirth Connect をダウンロードしてインストールする

ここから mirthconnect をダウンロードしてください。

次の形式のいずれかを使用して mirthconnect をインストールできます:1) RPM 2) tar.gz 2) インストーラー

このチュートリアルでは、mirthconnect インストールの tar.gz 形式を使用します。

まず、tar.gz のダウンロード リンクを取得し、以下に示すように wget コマンドを使用してサーバーに接続します。

cd ~
wget http://downloads.mirthcorp.com/connect/3.4.2.8129.b167/mirthconnect-3.4.2.8129.b167-unix.tar.gz

ダウンロードしたら、以下に示すように解凍します。

tar xvfz mirthconnect-3.4.2.8129.b167-unix.tar.gz

デフォルトでは、現在のディレクトリの下に「Mirth Connect」ディレクトリが作成されます。

これをより適切に管理するには、これを /opt ディレクトリに移動し、名前の「スペース」を削除して、Linux 環境で管理しやすいようにすべて小文字にします。

この例では、「Mirth Connect」の名前を「mirthconnect」に変更すると同時に、以下に示すように /opt ディレクトリに移動します。

mv Mirth\ Connect/ /opt/mirthconnect

注:RPM ファイルからインストールする場合は、次の手順を実行してください:

cd ~
wget http://downloads.mirthcorp.com/connect/3.4.2.8129.b167/mirthconnect-3.4.2.8129.b167-linux.rpm

以下に示すように、rpm コマンドを使用して RPM mirthconnect ファイルをインストールします。

rpm -ivh mirthconnect-3.4.2.8129.b167-linux.rpm

ステップ 5:MirthConnect 構成ファイルを変更する

メインの mirthconnect プロパティ ファイルは、/opt/mirthconnect/conf ディレクトリにある mirth.properties です。

vi /opt/mirthconnect/conf/mirth.properties

このファイルで、次のパラメータを変更します:

http.port = 8080
https.port = 8443
database = mysql
database.url = jdbc:mysql://localhost:3306/thegeekstuff
database.username = thegeekstuff
database.password = DBSecretPwd!

上記では:

  • http.port – 8080 はデフォルトの mirthconnect HTTP ポートです。この値は、環境に合わせて変更できます。
  • https.port – 8443 はデフォルトの mirthconnect HTTP ポートです。この値は、環境に合わせて変更できます。
  • database – デフォルトでは、derby と表示されます。上記のように、この値を mysql に変更してください。
  • database.url – MySQL データベースを使用しているため、この database.url を上記の値に設定します。デフォルトでは、これはデフォルトの derby データベースを指します。この値を変更します。 URL の最後に、以前に作成した mysql データベース名があることを確認してください。この値を構成ファイルのコメント行からコピーして貼り付けると、ここに mirthdb が含まれます。これをデータベース名に変更する必要があります。
  • database.username – 前に作成した mysql ユーザーに設定します。
  • database.password – この値を mysql ユーザー名に対応するパスワードに設定します。

ステップ 6:MirthConnect を開始する

ここで、mcservice コマンドを使用して mirthconnect をサービスとして開始します。

# /opt/mirthconnect/mcservice start
Starting mcservice

# /opt/mirthconnect/mcservice status
The daemon is running.

以下に示すように、ps を実行して、バックグラウンドで実行されている「mcservice」プロセスを確認することもできます。

# ps -ef | grep mcservice
root     26665     1  0 07:41 pts/2    00:01:57 /usr/bin/java -Dinstall4j.jvmDir=/usr 
  -Dexe4j.moduleName=/opt/mirthconnect/mcservice -Dinstall4j.launcherId=144 
  -Dinstall4j.swt=false -server -Xmx256m -Djava.awt.headless=true -Di4j.vmov=true 
  -Di4j.vmov=true -Di4j.vpt=true 
  -classpath /opt/mirthconnect/.install4j/i4jruntime.jar:/opt/mirthconnect/mirth-server-launcher.jar 
  com.install4j.runtime.launcher.Launcher start 
  com.mirth.connect.server.launcher.MirthLauncher false false   
  true true false  true true 0 0  20 20 Arial 0,0,0 8 500 
  version 3.4.2.8129.b167 20 40 Arial 0,0,0 8 500 -1

注:初めて mirthconnect を起動すると、MySQL データベースに接続され、必要なすべてのテーブルが作成されます。

ここで mysql に接続すると、mirthconnect が適切に動作するために必要な 13 個の新しいテーブルが作成されていることがわかります。

MariaDB [thegeekstuff]> show tables;
+-----------------------+
| Tables_in_thegeekstuff|
+-----------------------+
| ALERT                 |
| CHANNEL               |
| CHANNEL_GROUP         |
| CODE_TEMPLATE         |
| CODE_TEMPLATE_LIBRARY |
| CONFIGURATION         |
| D_CHANNELS            |
| EVENT                 |
| PERSON                |
| PERSON_PASSWORD       |
| PERSON_PREFERENCE     |
| SCHEMA_INFO           |
| SCRIPT                |
+-----------------------+
13 rows in set (0.00 sec)

ステップ 7:Mirthconnect を Systemd に追加する

CentOS 7 (または RedHat) を実行している場合は、systemd スタートアップに mirthconnect を追加することをお勧めします。

このために、次の mirthconnect.service ファイルを作成します

# vi /usr/lib/systemd/system/mirthconnect.service
[Unit]
Description=MirthConnect
After=network.target

[Service]
Type=forking

User=root
Group=root
ExecStart=/opt/mirthconnect/mcservice start
ExecStop=/opt/mirthconnect/mcservice stop
ExecRestart=/opt/mirthconnect/mcservice	restart

TimeoutSec=60

[Install]
WantedBy=multi-user.target

注:root 以外の別のユーザーとして mirthconnect をインストールした場合は、上記のファイルのユーザーとグループを適宜変更してください。

その後、以下に示すように、systemctl を使用して mirthconnect を開始および停止できます。

systemctl start mirthconnect

systemctl stop mirthconnect

サーバーの再起動時に自動的に起動するようにするには、以下に示すように、この systemd サーバーを起動用に有効​​にします。

systemctl enable mirthconnect

ステップ 8:MirthConnect 管理者にログイン

次の HTTP または HTTPS URL を使用できます:

  • http://{your-ip-address}:8080
  • https://{your-ip-address}:8443

Mirth Connect UI には次の 2 つのオプションがあります:

<オール>
  • MirthConnect Administartor – java webstart を使用して管理者 UI を起動します。
  • ウェブ ダッシュボード サインイン – http で URL を起動すると、[安全なサイトにアクセス] ボタンが表示されます。それをクリックして、ブラウザから mirthconnect を使用します。 HTTPS URL を使用すると、ここにユーザー名とパスワードのテキストボックスが表示されます。
  • mirthconnect のデフォルトのユーザー名とパスワードは admin/admin です。

    以下は、Mirth Connect Web ダッシュボードのスクリーンショットです:

    [Launch mirthconnect administrator] webstart ボタンをクリックすると、「webstart.jnlp」というファイルがシステムにダウンロードされます。これをダブルクリックして、Webstart を起動します。

    初回は、「アプリケーションを検証しています」というダイアログが表示されます。これは、起動している mirthconnect の場所の完全な URL を表示することで、どの mirthconnect を起動しているかも示します。

    次に、Java は警告メッセージを表示し、「このアプリケーションを実行しますか?」と尋ねます。 「実行」をクリックします。これにより、最終的に次の mirthconnect ログイン ボックスが表示されます。サーバー列には、デフォルトで正しい URL が入力されます。ここに適切な値が表示されない場合は、次のように入力してください:https://{your-ip-address}:8443

    ユーザー名とパスワードを入力します。初めて行う場合、ユーザー名とパスワードは admin です。

    初めてログインするときは、管理者パスワードを変更する必要があります。

    最後に、以下に示すように、Mirthconnect 管理者ダッシュボードが表示されます。ここから、チャネルを作成および管理することで、Mirthconnect を管理できます。

    Mirth Connect の起動に関する問題のトラブルシューティング

    mirthconect が正しく起動しない場合は、次の mirth ログ ファイルで問題がないか確認してください。

    tail -100 /opt/mirthconnect/logs/mirth.log
    

    また、デバッグ目的で、firewalld と selinux を一時的に無効にして、何らかの理由で mirthconnect がブロックされていないことを確認することもできます。

    firewalld を停止するには、次の手順を実行します。

    systemctl stop firewalld
    

    以下に示すように、SELinux を一時的に無効にします。

    setenforce 0
    

    その後、mirthconnect を再起動して、正常に起動するかどうかを確認してください。

    マース コネクトのディレクトリ構造

    デフォルトでは、/opt/mirthconnect のインストール ディレクトリの下に、次のディレクトリが表示されます。

    • conf – すべての mirthconnect 構成ファイルはここにあります
    • webapps – これは、mirthconnect websserver によって公開され、webapps をホストするディレクトリです
    • server-lib – すべての mirthconnect サーバー ライブラリ ファイルはここにあります
    • public_html – mirthconnect Web サーバーによって公開され、html ファイルをホストするディレクトリ
    • manager-lib – このディレクトリには、Mirthconnect Server Manager が使用するすべてのライブラリが含まれます
    • 拡張機能 – プラグインとコネクタで使用されるすべてのライブラリとメタデータがここにあります
    • docs – ドキュメント ディレクトリ
    • custom-lib – このディレクトリには、名前が示すように、すべてのカスタム ライブラリ ファイルを配置できます。これらのライブラリは、起動時に mirthconnect サーバーに読み込まれます。
    • cli-lib – Mirthconnect コマンドライン インターフェース ライブラリはこのディレクトリにあります
    • client-lib – mirthconnect 管理者ライブラリが含まれます

    上記のディレクトリとは別に、次のファイルも表示されます:

    • mcservice.vmoptions および mcserver.vmoptions – Mirthconnect の Java メモリ設定
    • mcservice – Mirth Connect Service Deamon の開始、停止、ステータスの表示に使用
    • mcserver – サービス オプションを使用していない場合は、これを使用して Mirth Connect を非サービス モードで開始します。
    • mcmanager – これは mirthconnect サーバー マネージャーです
    • mccommand – Mirthconnect コマンド ライン ユーティリティ
    • mirth-server-launcher.jar、mirth-manager-launcher.jar、mirth-cli-launcher.jar – mirth Connect サーバー、マネージャー、cli でそれぞれ使用される Jar ファイル

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