この問題は通常、Cpanelのバージョンをアップグレードするときに発生しました。この問題を解決するには、以下の手順に従ってください。-
1） まず、ファイルの権限を確認する必要があります
/usr/local/cpanel/3rdparty/bin/php
/usr/local/cpanel/3rdparty/bin/php-cgi
2） 上記の両方のファイルには755のアクセス許可が必要です。それが755のアクセス許可でない場合は、アクセス許可を755に変更してください。
3） 権限が変更されたら、シェルから以下のコマンドを実行します
/scripts/makecpphp
これで、phpMyAdminの「500内部サーバーエラー」は表示されなくなります。