reprepro は新しいバージョンのパッケージをリポジトリに受け入れることができますか?

解決策 1:

Reprepro は、同じディストリビューションにパッケージの 2 つのバージョンを保持することはできません。

ここで質問 3.1 への回答を参照してください。 FAQ;hb=HEAD

解決策 2:

dpkg をビルドするときは、こちらに従ってパッケージ バージョンをインクリメントする必要があります。

Debian リビジョン番号 (パッケージの末尾にある -xxx) は、インクリメントする必要がある番号です。