いくつかの理由:
<オール>BCrypt ベースのスキームは NIST の承認を受けていません。
ハッシュ関数はこのような用途向けに設計されていますが、Blowfish はそうではありませんでした。
追加されたセキュリティは、BCrypt がアルゴリズムの種類ではなく、計算コストが高いことに基づいていることです。計算コストの高い操作に依存することは、長期的なセキュリティには適していません。
これに関する議論については、http://en.wikipedia.org/wiki/Crypt_%28Unix%29 を参照してください。
OpenSUSE 11.4 (少なくとも) はデフォルトで Bcrypt を使用します。