これは Chrome 53 の Ubuntu のバグなので、新しいバージョンにアップグレードしてください。
証明書の透過性は、Google Chrome (およびそれを使用することを選択したその他のブラウザー) が、証明書が正当に発行されたものであることを確認する方法です。
透過性が有効であるとマークされている証明書の場合 (証明書の oid は 1.3.6.1.4.1.11129.2.4.2 です)。 Chrome は、発行元の認証局の証明書透明性ログをチェックして、証明書が存在することを確認します。
ただし、一部の認証局では、ログ内のドメイン名の一部を編集することを選択しています (特にプライベート リソースの場合)。
ここで最も可能性の高いシナリオは、Namecheap が Geotrust (発行者) で files.namecheap.com の透明性ログを編集するよう要求したため、Google Chrome が証明書が合法的に発行されたことを確認できないことです。
ここでのオプションは、Namecheap でチケットを作成し、編集せずに証明書を発行できるかどうかを確認し、その間に例外を追加することです (証明書を信頼する場合)。