Pulse Audio を使用して、異なるアプリケーションを異なるオーディオ出力にルーティングすることは可能ですか?

はい、これは PulseAudio の組み込み機能です。 pavucontrolなどPA対応の「ボリュームミキサー」各種 または ponymix 各プログラムに異なる出力を割り当てることができます (PA が実際にこれらの出力を別個のものとして認識すると仮定します)。

イヤーキャンディーをお試しください。出力が接続されているときに出力を切り替えるだけでなく、必要に応じて複数のプログラムを他の出力にルーティングすることもできます (およびその他の多くの小さな改善)。