不明な関数:vundle#begin

あなたの .vimrc は問題ないようです。バンドル プラグインが正しくインストールされていないようです。コンソールでこのコマンドを実行してください。

git clone https://github.com/gmarik/Vundle.vim.git ~/.vim/bundle/Vundle.vim

次のようなディレクトリ構造が必要です (簡略化しました):

~/.vim
├── bundle/
│   └── Vundle.vim  <------------------ Vundle
├── colors/
│   └── Tomorrow.vim
└── plugin/
    └── acp.vim

rtp の場所が間違っている可能性があります。

と入力してください。

:echo &rtp  

Vim で ~ の場所を確認する の略は正しいです。

交換できます

set rtp+=~/.vim/bundle/Vundle.vim

へ

set rtp+=/home/[YourUserName]/.vim/bundle/Vundle.vim   //do not use ~